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lamp引物设计

发布时间: 2021-03-04 00:20:03

⑴ 师兄师姐们,有没有好的LAMP引物设计软件或网站

primerexplore.jp/e/这个网站可以

⑵ LAMP引物怎么设计

一般是根据产物来设计。

⑶ PCR与LAMP的关系

这两个方法我感觉原理还差挺多的,

LAMP,环介导等温扩增法,英文名称为loop-mediatedisothermal amplification,,是一种新型的核酸扩增方法,其特点是针对靶基因的6个区域设计4种特异引物,在链置换DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)的作用下,60--65℃恒温扩增,15-60分钟左右即可实现10^9~10^10倍的核酸扩增

PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链,重复循环变性--退火--延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。

两者的酶,引物的设计,扩增的流程,产物的检验均不同,所以应该关系不大吧。而且虽然LAMP相对简便一些,但两者还是各有利弊的。

希望对你有帮助,望采纳

⑷ lamp环引物是做什么用的原理又是什么

增加反应速度的.
直接从环引物这里开始扩增,速度就快了

⑸ 如何进行pcr引物设计

NCBI有免费的设计软件
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

非常好用,权威

把你的序列贴到最上方的空格就可版以了,开始的时候,所有的参权数都用系统的默认值就可以,不需要修改。

⑹ pcr引物设计的基本原则有哪些

  1. 引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;

  2. 引物GC含量内一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保容持接近;

  3. 引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3’的下降形状也有利于引物与模板的结合;

  4. ΔG值(自由能)反应了引物与模板结合的强弱程度,3'端的ΔG值相对要低,且绝对值不要超过9,否则不利于正确引发反应,3'末端双链的ΔG值在0--2kcal/mol时,PCR产量几乎达到百分之百,但在-6时只达到40%,-8时少于20%,-10时接近于0。

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