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lamp引物設計

發布時間: 2021-03-04 00:20:03

⑴ 師兄師姐們,有沒有好的LAMP引物設計軟體或網站

primerexplore.jp/e/這個網站可以

⑵ LAMP引物怎麼設計

一般是根據產物來設計。

⑶ PCR與LAMP的關系

這兩個方法我感覺原理還差挺多的,

LAMP,環介導等溫擴增法,英文名稱為loop-mediatedisothermal amplification,,是一種新型的核酸擴增方法,其特點是針對靶基因的6個區域設計4種特異引物,在鏈置換DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)的作用下,60--65℃恆溫擴增,15-60分鍾左右即可實現10^9~10^10倍的核酸擴增

PCR技術的基本原理類似於DNA的天然復制過程,其特異性依賴於與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成:①模板DNA的變性:模板DNA經加熱至93℃左右一定時間後,使模板DNA雙鏈或經PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;②模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經加熱變性成單鏈後,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合;③引物的延伸:DNA模板--引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按鹼基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈,重復循環變性--退火--延伸三過程就可獲得更多的「半保留復制鏈」,而且這種新鏈又可成為下次循環的模板。每完成一個循環需2~4分鍾,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。

兩者的酶,引物的設計,擴增的流程,產物的檢驗均不同,所以應該關系不大吧。而且雖然LAMP相對簡便一些,但兩者還是各有利弊的。

希望對你有幫助,望採納

⑷ lamp環引物是做什麼用的原理又是什麼

增加反應速度的.
直接從環引物這里開始擴增,速度就快了

⑸ 如何進行pcr引物設計

NCBI有免費的設計軟體
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

非常好用,權威

把你的序列貼到最上方的空格就可版以了,開始的時候,所有的參權數都用系統的默認值就可以,不需要修改。

⑹ pcr引物設計的基本原則有哪些

  1. 引物長度一般為15-30bp,常用的為18-27bp,但不能大於38bp;

  2. 引物GC含量內一般為40%-60%,以45-55%為宜,上下游引物GC含量和Tm值要保容持接近;

  3. 引物所對應的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之間,Tm值曲線以選取72度附近為佳,5'到 3』的下降形狀也有利於引物與模板的結合;

  4. ΔG值(自由能)反應了引物與模板結合的強弱程度,3'端的ΔG值相對要低,且絕對值不要超過9,否則不利於正確引發反應,3'末端雙鏈的ΔG值在0--2kcal/mol時,PCR產量幾乎達到百分之百,但在-6時只達到40%,-8時少於20%,-10時接近於0。

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